崇祯又问道：“对于锦衣卫指挥使的人选，你可有什么好主意吗？”
朱天明仔细回忆着明末的历史，突然灵机一动答道：“对了，李若琏可以！
李自成破北京时，这个李若琏率锦衣卫残部死守崇文门直到听闻你自缢的消息后，才带领全家自杀殉国，可以说对你是极度的忠诚，可以升任他为指挥使。
还有一个掌刑千户高文采当时率部死守宣武门，和李若琏一样，最后率全家自缢。此人也可以提拔重用。”
接下来的几天，两人反复的商议，最终确定下了详细的方案。
根据计划，崇祯皇帝也相应的进行了人事和政策的调整。
依照商议的方案，先是召见了锦衣卫指挥同知李若琏，一番深谈对他的忠诚刚正颇为欣赏。
当即取出两份早已拟好的圣旨交给李若琏，李若琏跪接圣旨。
崇祯皇帝双手将他搀扶起来，神情严肃的对他说道：“李爱卿，如今天下并不太平，外有建奴、蒙古、安南等虎视眈眈，内有贪官佞臣欺朕害民。
朕只有一人，无法遍观天下，无法尽识人心，更无法惩尽天下恶人，所以今后你要做朕的耳目，朕的利刃，外荡贼寇，内除奸邪，辅佐朕重现永宣盛世。
朕不求名垂清史，惟愿天下百姓都能耕有地，居有屋，饥有食，寒有衣，不受外族屠戮，不受赃官欺凌，你可愿助朕否。”
李若琏双目含泪道：“锦衣卫本就是天子鹰犬，臣必当尽心竭力以报皇上知遇之恩，以一身忠骨铸天子利剑。”
崇祯又道：“这两道圣旨，一道是委你任锦衣卫指挥使。另一道是革去原任指挥使田而耕之职，投入诏狱等候裁处。你即刻召集可信之人持旨意前往接管锦衣卫，不得有误。”
李若琏奉旨而出，立刻派人紧急召集了300名亲信校尉包围田而耕府邸，宣读圣旨后将其缉拿押往诏狱。
处置完毕后李若琏带人赶回锦衣卫指挥使司衙门，以指挥使的官房发出命令，召集所有在京千户以上官员到衙议事。
待人齐后当众宣布了崇祯皇帝的两道圣旨，好在圣命之下，田尔耕的亲信虽然心中不满，倒也没有抗旨的胆子。次日崇祯皇帝下旨升千户高文采任锦衣卫指挥同知。
待二人顺利接管锦衣卫后，崇祯皇帝诏魏忠贤面君。魏忠贤心知不妙，进殿之后趴伏于地战战兢兢的口称万岁。
崇祯皇帝并未让他平身，只是一本一本的翻看着御案上那一大摞题本。
跪了足有两炷香的时间，魏忠贤又试探着喊了一句万岁。
崇祯突然一把将御案上那一大摞题本扔到了魏忠贤的面前道：“九千岁行如此大礼，朕怎么当得起呀。”
闻听此言魏忠贤吓得魂不附体道：“罪臣该死，罪臣该死，皇上息怒呀。”
崇祯皇帝冷笑道：”该死吗？不会吧。未闻天下有人给朕立生祠的，可你九千岁的生祠可是遍布天下呀。”
魏忠贤更加恐惧了，哭号道：“罪臣该死，罪臣知罪了，请陛下降罪。”
崇祯皇帝又是一声冷笑：”降罪？朕怎么敢呀，谁不知道你九千岁门下五虎、五彪、十狗、十孩儿、四十孙，权倾天下只手遮天好不威风。朕怎么敢治你的罪。”
魏忠贤的哭告声和磕头的咚咚声回绕在大殿之中。
崇祯凝视着魏忠贤好一阵，见已经把他吓得差不多了，才说道：“好了，看看那些题本吧，都是弹劾你的，满朝文武都欲致你于死地而后快，朕也维护不了你。”
魏忠贤哭道：“罪臣知罪了，罪臣该死，可罪臣对皇上的忠心天地可鉴呀。”
崇祯皇帝叹息了一声道：“哎，朕也知道你对皇兄对朕还是有几分忠爱之心的，若不是看在这点，以你犯下的罪过，就是诛了你九族都不为过。
眼下朝议汹汹，大有不把你凌迟不罢休的势头。朕念你伺候皇兄还算尽心，不忍加诛于你。
那九千九百岁的称号去了吧，还有你那些生祠，全部拆掉，把强占的地还与百姓，所拆物料变卖之后，所得银两捐作军饷吧。
你先去南京待上些时日吧，等风头过了再回来。到了南京仔细你的言行，若是再被人抓住什么把柄，引起朝堂公愤，朕也没法再救你了。”
魏忠贤磕头如捣蒜，连连谢恩。
随后崇祯皇帝下旨罢免魏忠贤一切司职，遣往南京为太祖守陵。
司礼监掌印由王承恩接任，曹化淳接任东厂掌印太监，并擢升后来以一己之力斩杀数十名闯军的传奇太监方正化为御马监。
之后在锦衣卫的秘密监视之下，魏忠贤责人拆除了所有生祠，返还百姓土地。
将拆除物料变卖共得银140余万两，又变卖家财筹银50余万，共计200万两捐入内帑。
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